Johann Christian Friedrich Haeffner, ofta förkortad J.C.F. Haeffner även stavat Hæffner, född 2 mars 1759 i byn Oberschönau i Hessen-Kassel, död 28 maj 1833 i Uppsala, var en tyskfödd tonsättare och musiker verksam i Sverige, bland annat ansvarig för Haeffners koralbok. Haeffner var hovkapellmästare, domkyrkoorganist och director musices vid Uppsala universitet. Haeffner är begraven på Uppsala gamla kyrkogård.